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有关上海海洋大学申报2018-2019年度神农中华农业科技奖推荐项目的公示

发布于:2019/02/26 浏览次数:183

有关上海海洋大学申报2018-2019年度神农中华农业科技奖推荐项目的公示

 

上海海洋大学申报2018-2019年度神农中华农业科技奖的推荐项目公示如下:

一、项目总体情况

成果名称

鲆鳎鱼类重要性状遗传解析及分子育种技术创建与应用

申报奖励种类

科学研究类

主要完成人

陈松林,邵长伟,鲍宝龙,王娜,王磊,田永胜,李仰真,薛致勇,徐文腾,崔忠凯,周茜,刘洋,杨英明,李希红,朱颖,郑卫卫

完成单位

中国水产科学研究院黄海水产研究所,上海海洋大学,山东省海阳市黄海水产有限公司

 

 

 

 

 

 

牙鲆和半滑舌鳎是我国重要海水养殖鱼类,但其雌雄差异大、抗病力差、苗种成活率低等问题严重影响了其养殖业的可持续发展。有关牙鲆变 态、抗病和性别分化等性状形成的分子机理报道很少,影响了分子育种技术的建立,限制了养殖产业的发展。本项目近8年来对牙鲆和半滑舌鳎变 态发育、抗病及性别分化等性状的遗传基础及基因组育种技术进行了系统研究,取得了如下创新性成果:

1.揭示变 态发育的分子机制:通过比较基因组和转录组鉴定到21个甲状腺素信号通路基因以及9个视黄酸信号通路基因,发现视黄酸通过干扰甲状腺激素对视黄酸受体/甲状腺激素受体形成的异二聚体作用而抑制眼睛移动,揭示了牙鲆眼睛移动受甲状腺激素和视黄酸信号通路的双重拮抗调控的机制;发现视蛋白通过促进视黄酸合成调控比目鱼体色不对称发育,揭示了比目鱼体色左右不对称的形成机制。

2.揭示抗细菌病性状的分子机制:通过牙鲆高密度SNP遗传连锁图谱和QTL精细定位,鉴定到多个抗细菌病相关QTL位点,结合蛋白组学分析,鉴定到多个抗病免疫基因(C1ql3CCR6ACCR6B等);通过对半滑舌鳎抗病家系和不抗病家系800多个体的基因组重测序和GWAS分析,筛选到抗细菌病关键基因-Perforin-like,其在抗病家系的表达水平明显高于不抗病家系,其重组蛋白具抑菌活性,初步揭示了抗病家系抗病力升高的分子机制。

3.揭示性逆转的表观遗传调控机制:首次绘制了国际上第一张非模式生物的单碱基分辨率甲基化图谱;发现半滑舌鳎性逆转后发生的甲基化改变,显著富集于性别决定通路有关基因;发现伪雄鱼的Z染色体并没有发生全局剂量补偿,而是存在一个局部的剂量补偿区域,该区域富集甲基化位点以及存在与精 子发生相关的基因。克隆和表征了半滑舌鳎15个性别分化和配子发生相关基因,初步揭示性别分化和精 子发生的机制。 

4.创建鲆鳎鱼类基因组编辑和基因组选择育种技术:首次建立半滑舌鳎基因组编辑技术,证明dmrt1基因是半滑舌鳎雄性决定基因。通过对牙鲆参考群体和候选群体1000多个体的全基因组重测序,鉴定出1934475SNP位点,利用BayesCπGBLUP算法进行基因组估计育种值计算,指导牙鲆抗病良种选育,建立了牙鲆抗病性状全基因组选择育种技术。

5.创制抗病高产牙鲆新品种:采用基因组选择技术,培育出牙鲆鲆优2号新品种,2016年通过国家水产良种审定,并获新品种证书。该品种比普通牙鲆生长速度提高20%左右,养殖成活率提高20%左右。

 

上述成果发表论文72篇,其中SCI论文48篇,包括Nature Genetics论文1篇,出版《鱼类基因组学和基因组育种技术》专著1部,获授权发明专利8项。培育新品种1个。成果推广应用后产生显著的经济效益,推动我国鱼类基因组研究进入国际领先行业,加快了我国鱼类种业的科技进步,社会效益显著。


二、主要完成人贡献

名次

 

 

对成果的主要贡献

1

陈松林

中国水产科学研究院黄海水产研究所

项目负责人。课题设计、组织实施,领衔完成牙鲆基因组精细图谱绘制,组织、指导完成抗病等性状的遗传解析;发明半滑舌鳎基因组编辑技术和牙鲆基因组选择育种技术。主编鱼类基因组学和基因组育种技术专著。为7项发明专利的第一完成人,为Nature GenetGenome Res42SCI论文的通讯作者。

2

邵长伟

中国水产科学研究院黄海水产研究所

项目骨干。完成牙鲆高密度SNP遗传图谱及基因组精细图谱绘制,发掘牙鲆变 态发育相关重要基因,进行半滑舌鳎全基因组甲基化分析,揭示性逆转的表观遗传调控机制。为Nature GenetGenome Res3SCI论文的第一作者。

3

鲍宝龙

上海海洋大学

完成牙鲆变 态相关重要基因的功能验证,解析牙鲆眼睛移动和变 态发育的分子机制。为Nature Genet论文的共同第一作者和Mech Devel论文的通讯作者。

4

王娜

中国水产科学研究院黄海水产研究所

进行半滑舌鳎和牙鲆变 态和白化机制的研究,筛选出白化、变 态和性腺发育等相关基因,参与建立半滑舌鳎基因组编辑技术;进行课题管理。以第一或通讯作者发表SCI论文4篇。

5

王磊

中国水产科学研究院黄海水产研究所

进行家系感染实验和抗病性能分析,克隆和表征牙鲆抗病免疫相关基因,揭示抗细菌病机制。以第一作者发表抗病性状相关基因的SCI论文3篇。

6

田永胜

中国水产科学研究院黄海水产研究所

负责863计划鲆鲽类良种培育课题的实施管理,进行牙鲆家系构建和生长性能测试,参与培育鲆优2号牙鲆新品种。

7

李仰真

中国水产科学研究院黄海水产研究所

负责牙鲆和半滑舌鳎家系构建和选育,进行家系的抗病性能测试和抗病性状遗传力分析,进行鲆优2号的对照养殖,参与培育出牙鲆鲆优2号新品种。以第一作者发表遗传参数评估的SCI论文2篇。

8

薛致勇

海阳市黄海水产有限公司

负责提供牙鲆和半滑舌鳎家系选育车间和部分亲鱼材料,进行苗种培育和管理,参与培育出鲆优2号牙鲆新品种。

9

徐文腾

中国水产科学研究院黄海水产研究所

克隆和表征半滑舌鳎精 子发生和性别分化相关基因3个,初步揭示舌鳎性别分化和精 子发生的分子机制。以第一作者发表SCI论文2篇。

10

崔忠凯

中国水产科学研究院黄海水产研究所

进行半滑舌鳎基因组编辑技术研究,负责胚胎显微注射和苗种培育工作,作为骨干参与建立半滑舌鳎基因组编辑技术。以第一作者发表半滑舌鳎基因组编辑的SCI论文。

11

周茜

中国水产科学研究院黄海水产研究所

进行半滑舌鳎参考群体的基因组重测序和SNP位点筛选及GWAS分析,发掘半滑舌鳎抗病性状相关SNP位点,参与建立抗病性状基因组选择技术。

12

刘洋

中国水产科学研究院黄海水产研究所

进行牙鲆抗病性状基因组选择技术研究,负责SNP遗传效应和基因组育种值计算,定位白化和变 态相关QTL,参与建立抗病性状基因组选择育种技术。以第一作者发表SCI论文3篇。

13

杨英明

中国水产科学研究院黄海水产研究所

负责牙鲆等亲鱼繁殖和家系苗种培育,进行基因编辑舌鳎鱼苗的养殖,参与培育鲆优2号牙鲆新品种。

14

李希红

中国水产科学研究院黄海水产研究所

参与舌鳎转录组分析、基因克隆与表达分析。承担部分项目运行的管理工作。

15

朱颖

中国水产科学研究院黄海水产研究所

克隆与表征舌鳎性别分化相关基因3个,进行性别相关基因的组织原位杂交,参与性别分化机制的研究。以第一作者发表SCI论文3篇。

16

郑卫卫

中国水产科学研究院黄海水产研究所

参与牙鲆家系建立、感染及抗病家系选育工作,以第一作者发表论文1篇。

 

公示期为2019226日至35日,如有异议,请在公示期内以书面形式实名提出。

联系人:周婷婷,联系电话:021-61900066,邮箱:ttzhou@shou.edu.cn

                                              上海海洋大学

                                                 科技处