| 序号 | 平台基地名称 | 批准部门 | 负责人 |
| 1 | 国家远洋渔业工程技术研究中心 | 科技部 | 万荣 |
| 2 | 海洋生物科学国际联合研究中心 | 科技部 | 陈良标 |
| 3 | 船舶压载水检测试验室 | 国家发改委 | 吴惠仙 |
| 4 | 远洋渔业培训中心 | 农业部 | 陈新军 |
| 5 | 冷库及制冷设备质量监督检验测试中心 | 农业部 | 李家乐 |
| 6 | 国家水生动物病原库 | 农业部 | 吕利群 |
| 7 | 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 | 教育部 | 陈良标 |
| 8 | 鱼类营养与环境生态研究中心 | 农业部 | 刘其根 |
| 9 | 中国渔业发展战略研究中心 | 农业部 | 平瑛 |
| 10 | 水域环境生态上海高校工程研究中心 | 市教委 | 何培民 |
| 11 | 大洋渔业资源可持续开发实验室 | 教育部 | 陈新军 |
| 12 | 水产养殖上海工程技术研究中心 | 市科委 | 谭洪新 |
| 13 | 大洋渔业资源环境科学观测实验站 | 农业部 | 戴小杰 |
| 14 | 淡水水产种质资源与利用重点实验室 | 农业部 | 成永旭 |
| 15 | 国家淡水水产品加工技术研发分中心(上海) | 农业部 | 陈舜胜 |
| 16 | 水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室 | 农业部 | 王锡昌 |
| 17 | 水产品加工及贮藏上海工程技术研究中心 | 市科委 | 谢晶 |
| 18 | 团头鲂遗传育种中心 | 农业部 | 邹曙明 |
| 19 | 水产动物遗传育种上海市协同创新中心 | 上海市 | 李家乐 |
| 20 | 上海高校远洋渔业协同创新中心 | 市教委 | 陈新军 |
| 21 | 上海社会调查研究中心上海海洋大学分中心（民生与食品安全） | 上海市 | 赵勇、平瑛 |
| 22 | 水产品加工及贮藏上海高校重点实验室 | 市教委 | 潘迎捷 |
| 23 | 海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室 | 市教委 | 唐文乔 |
| 24 | 上海市深渊科学工程技术研究中心 | 市科委 | 方家松 |
| 25 | 中国远洋渔业数据中心 | 农业部 | 陈新军 |
| 26 | 海洋产业发展战略研究中心 | 市教委 | 平瑛 |
| 27 | 上海港口及近海生态环境科技服务平台 | 市科委 | 吴惠仙 |
| 28 | 大洋渔业开发重点实验室 | 农业部 | 陈新军 |
| 29 | 渔业信息重点实验室 | 农业部 | 陈明 |
| 30 | 水产品加工副产物综合利用技术集成基地 | 农业部 | 谢晶 |
| 31 | 冷链装备性能测试与节能评价公共服务平台 | 市科委 | 谢晶 |
| 32 | 上海河口海洋测绘工程技术研究中心 | 市科委 | 韩震 |
| 33 | 国家食物营养教育示范基地 | 国家食物与营养咨询委员会 | 赵勇 |
| 34 | 海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心 | 教育部 | 谢晶 |
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